Técnicas de Taxonomia Moderna

Código: ERN.702

Carga Horária: 30 horas

Créditos: 02 (1T, 1P)

Professor(a) Responsável: Profa. Dra. Maria Elina Bichuete

Professor(a) Colaborador(a): Prof. Dr. Marcel Santos de Araújo (Pós-Doc-PPGERN)

Objetivos: Aprender o uso adequado de técnicas de taxonomia moderna utilizando softwares (como Open Delta Suite, Adobe Illustrator e Adobe Photoshop), visando diminuir o tempo de processamento e o controle de qualidade dos dados para submissão de trabalhos.

Tópicos Abordados

Open Delta Suite

Ferramenta usada por taxonomistas para (re) descrever taxa em um formato padronizado, o que torna a informação prontamente disponível para estudos comparativos (filogenéticos), catalogação de listas de fauna e construção de chaves interativas ilustradas. O tempo de processamento e o controle de qualidade dos dados estão sendo otimizados pelo DELTA, pois todos os dados devem ser tratados de forma idêntica.

  1. Conceitos de base de dados e funcionamento de protodescrições
  2. Inserção, importação e exportação de dados
  3. Linhas de código, comandos e funções
  4. Chaves dicotômicas e interativas
  5. Matrizes para análises filogenéticas

Ilustração Científica Digital

Os participantes aprenderão a fazer ilustrações científicas com o método de desenho digital usando o programa de software Adobe Illustrator. Em muitos laboratórios, isso se tornou um método padrão para fazer descrições taxonômicas, pois existem grandes vantagens na velocidade de trabalho, editando as ilustrações e a facilidade de criação de linhas muito suaves. Os gráficos vetoriais resultantes têm tamanhos de arquivo muito pequenos, de alta resolução e podem ser processados diretamente pela maioria das revistas online. Fotos e micrografias podem ser usadas como modelos para fazer os desenhos de linhas. Uma solução para a ilustração de detalhes complexos (como seta) será oferecida fazendo bibliotecas para essas estruturas.

  1. Histórico e conceitos
  2. Ferramentas
  3. Aplicações dos softwares Adobe Illustrator, Adobe Photoshop, Gimp e Inkscape
  4. Funções e scripts

Bibliografia

BROWN, B.V. (2013) Automating the “material examined” section of taxonomic papers to speed up species descriptions. Zootaxa 3683, 297-299.

CHETVERIKOV, P.E. (2016) Video projector: a ditial replacement for camera Lucida for drawing mites and other microscopic objects. Systematic and Applied Acarology 21, 1278-1280.

COLEMAN, C.O.; LOWRY, J.K. & MACFARLANE, T. (2010) DELTA for Beginners: Na introduction into the taxonomy software package DELTA. Zookeys 45, 1-75.

DALLWITZ, M.J., PAINE, T.A. & ZURCHER, E.J. (2013) Principles of interactive Keys. Available from: http://delta-intkey.com

FISHER, J.R. & DOWLING, A.P.G. (2010) Modern methods and technology for doing classical taxonomy. Acarologia 50, 395-409.

GASTON, K.J. & O’NEILL, M.A. (2004) Automateed species identification: why not? Philosophical transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 359, 655-667.

SIDORCHUK, E.A. & VORONTSOV, D.D. (2014) Computer-aided drawing system – substitute for camera lucida. Acarologia 54, 229-239.

Critérios de Avaliação

A avaliação será realizada através de exercícios, verificando o desenvolvimento dos alunos através das soluções que encontram para um mesmo problema. Uma apresentação do trabalho (arquivos) a serem entregues ao final do curso, como a descrição gerada ou chave taxonômica, e uma prancha do grupo de estudo do aluno.